MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9

Total Repeats: 38067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019435	T	7	7	84	90	0 %	100 %	0 %	0 %	414073324
2	NC_019435	TGTC	2	8	110	117	0 %	50 %	25 %	25 %	414073324
3	NC_019435	CTTG	2	8	138	145	0 %	50 %	25 %	25 %	414073324
4	NC_019435	A	6	6	157	162	100 %	0 %	0 %	0 %	414073324
5	NC_019435	ATT	2	6	164	169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073324
6	NC_019435	A	6	6	172	177	100 %	0 %	0 %	0 %	414073324
7	NC_019435	GAT	2	6	222	227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073324
8	NC_019435	ATG	2	6	248	253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073324
9	NC_019435	CGT	2	6	274	279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073324
10	NC_019435	AATC	2	8	286	293	50 %	25 %	0 %	25 %	414073324
11	NC_019435	TGA	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073324
12	NC_019435	TTGCTG	2	12	419	430	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414073324
13	NC_019435	TGG	2	6	468	473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073324
14	NC_019435	ATGC	2	8	499	506	25 %	25 %	25 %	25 %	414073324
15	NC_019435	ACTT	2	8	644	651	25 %	50 %	0 %	25 %	414073324
16	NC_019435	GAT	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073324
17	NC_019435	AAG	2	6	683	688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073324
18	NC_019435	ACT	2	6	826	831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073324
19	NC_019435	A	6	6	1056	1061	100 %	0 %	0 %	0 %	414073324
20	NC_019435	CAA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073324
21	NC_019435	A	8	8	1095	1102	100 %	0 %	0 %	0 %	414073324
22	NC_019435	ATT	2	6	1121	1126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073324
23	NC_019435	ACA	2	6	1270	1275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073324
24	NC_019435	TAA	2	6	1539	1544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073325
25	NC_019435	TTGAAG	2	12	1628	1639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073325
26	NC_019435	TCAA	2	8	1678	1685	50 %	25 %	0 %	25 %	414073325
27	NC_019435	ATA	2	6	1703	1708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073325
28	NC_019435	TTA	2	6	1747	1752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073325
29	NC_019435	GCT	2	6	1756	1761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073325
30	NC_019435	GTA	2	6	1774	1779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073325
31	NC_019435	TTG	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073325
32	NC_019435	TTC	2	6	1917	1922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073325
33	NC_019435	TGAAAG	2	12	1931	1942	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414073325
34	NC_019435	GAAA	2	8	1947	1954	75 %	0 %	25 %	0 %	414073325
35	NC_019435	AGA	2	6	2097	2102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073325
36	NC_019435	ATG	2	6	2171	2176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073325
37	NC_019435	AAG	2	6	2177	2182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073325
38	NC_019435	TCA	2	6	2195	2200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073325
39	NC_019435	TTA	2	6	2238	2243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073325
40	NC_019435	TTGA	2	8	2251	2258	25 %	50 %	25 %	0 %	414073325
41	NC_019435	TGC	2	6	2328	2333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073325
42	NC_019435	CAAC	2	8	2381	2388	50 %	0 %	0 %	50 %	414073325
43	NC_019435	GAA	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073325
44	NC_019435	AAG	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073325
45	NC_019435	TATC	2	8	2501	2508	25 %	50 %	0 %	25 %	414073325
46	NC_019435	TGAT	2	8	2528	2535	25 %	50 %	25 %	0 %	414073325
47	NC_019435	GAA	2	6	2617	2622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073325
48	NC_019435	GTAC	2	8	2650	2657	25 %	25 %	25 %	25 %	414073325
49	NC_019435	AATT	2	8	2659	2666	50 %	50 %	0 %	0 %	414073325
50	NC_019435	TA	3	6	2780	2785	50 %	50 %	0 %	0 %	414073326
51	NC_019435	ATT	2	6	2814	2819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073326
52	NC_019435	GAA	2	6	2833	2838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
53	NC_019435	A	7	7	2843	2849	100 %	0 %	0 %	0 %	414073326
54	NC_019435	TAC	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073326
55	NC_019435	CTT	2	6	2873	2878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073326
56	NC_019435	GAAA	2	8	2898	2905	75 %	0 %	25 %	0 %	414073326
57	NC_019435	AAC	2	6	2969	2974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073326
58	NC_019435	TTA	2	6	2979	2984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073326
59	NC_019435	CAA	2	6	3005	3010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073326
60	NC_019435	A	6	6	3073	3078	100 %	0 %	0 %	0 %	414073326
61	NC_019435	A	7	7	3214	3220	100 %	0 %	0 %	0 %	414073326
62	NC_019435	AAC	2	6	3225	3230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073326
63	NC_019435	CAG	2	6	3316	3321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073326
64	NC_019435	GAA	2	6	3370	3375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
65	NC_019435	TTAT	2	8	3379	3386	25 %	75 %	0 %	0 %	414073326
66	NC_019435	TGT	2	6	3417	3422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073326
67	NC_019435	TGA	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
68	NC_019435	GAT	2	6	3489	3494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
69	NC_019435	AAAT	2	8	3507	3514	75 %	25 %	0 %	0 %	414073326
70	NC_019435	CTT	2	6	3539	3544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073326
71	NC_019435	TTA	2	6	3605	3610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073326
72	NC_019435	TGA	2	6	3612	3617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
73	NC_019435	A	6	6	3617	3622	100 %	0 %	0 %	0 %	414073326
74	NC_019435	AGA	2	6	3636	3641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
75	NC_019435	A	6	6	3716	3721	100 %	0 %	0 %	0 %	414073326
76	NC_019435	T	6	6	3735	3740	0 %	100 %	0 %	0 %	414073326
77	NC_019435	CAG	2	6	3770	3775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073326
78	NC_019435	GAAA	2	8	3792	3799	75 %	0 %	25 %	0 %	414073326
79	NC_019435	AAG	2	6	3836	3841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
80	NC_019435	T	6	6	3871	3876	0 %	100 %	0 %	0 %	414073326
81	NC_019435	A	8	8	3895	3902	100 %	0 %	0 %	0 %	414073326
82	NC_019435	GAT	2	6	3916	3921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
83	NC_019435	AAAGT	2	10	3938	3947	60 %	20 %	20 %	0 %	414073326
84	NC_019435	TGA	2	6	3966	3971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
85	NC_019435	AGA	2	6	4038	4043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
86	NC_019435	ACT	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073326
87	NC_019435	AAT	2	6	4138	4143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073326
88	NC_019435	A	6	6	4148	4153	100 %	0 %	0 %	0 %	414073326
89	NC_019435	A	7	7	4158	4164	100 %	0 %	0 %	0 %	414073326
90	NC_019435	TTC	2	6	4315	4320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073326
91	NC_019435	T	6	6	4325	4330	0 %	100 %	0 %	0 %	414073326
92	NC_019435	TGA	2	6	4332	4337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
93	NC_019435	ATGTTG	2	12	4415	4426	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414073326
94	NC_019435	TTG	2	6	4448	4453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073326
95	NC_019435	TGA	2	6	4572	4577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
96	NC_019435	A	7	7	4616	4622	100 %	0 %	0 %	0 %	414073326
97	NC_019435	GTCTT	2	10	4633	4642	0 %	60 %	20 %	20 %	414073326
98	NC_019435	AG	3	6	4659	4664	50 %	0 %	50 %	0 %	414073326
99	NC_019435	ATT	2	6	4728	4733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073326
100	NC_019435	TGA	2	6	4746	4751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
101	NC_019435	A	6	6	4751	4756	100 %	0 %	0 %	0 %	414073326
102	NC_019435	A	6	6	4763	4768	100 %	0 %	0 %	0 %	414073326
103	NC_019435	T	6	6	4892	4897	0 %	100 %	0 %	0 %	414073326
104	NC_019435	A	6	6	4943	4948	100 %	0 %	0 %	0 %	414073326
105	NC_019435	AC	3	6	4997	5002	50 %	0 %	0 %	50 %	414073326
106	NC_019435	TTG	2	6	5138	5143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073326
107	NC_019435	T	6	6	5148	5153	0 %	100 %	0 %	0 %	414073326
108	NC_019435	CAG	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073326
109	NC_019435	TGA	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
110	NC_019435	AAG	2	6	5234	5239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
111	NC_019435	AGA	2	6	5304	5309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
112	NC_019435	TGA	2	6	5355	5360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
113	NC_019435	AGT	2	6	5383	5388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
114	NC_019435	TGA	2	6	5427	5432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
115	NC_019435	TATT	2	8	5433	5440	25 %	75 %	0 %	0 %	414073326
116	NC_019435	GAA	2	6	5447	5452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
117	NC_019435	TCAT	2	8	5514	5521	25 %	50 %	0 %	25 %	414073326
118	NC_019435	ATG	2	6	5540	5545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
119	NC_019435	A	6	6	5603	5608	100 %	0 %	0 %	0 %	414073326
120	NC_019435	TTTA	2	8	5621	5628	25 %	75 %	0 %	0 %	414073326
121	NC_019435	AACC	2	8	5638	5645	50 %	0 %	0 %	50 %	414073326
122	NC_019435	ATG	2	6	5711	5716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073326
123	NC_019435	AGA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
124	NC_019435	A	6	6	5772	5777	100 %	0 %	0 %	0 %	414073326
125	NC_019435	GAA	3	9	5794	5802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073326
126	NC_019435	CAAT	2	8	5876	5883	50 %	25 %	0 %	25 %	414073326
127	NC_019435	AAT	2	6	5886	5891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073326
128	NC_019435	TCAG	2	8	5913	5920	25 %	25 %	25 %	25 %	414073326
129	NC_019435	ATGA	2	8	5986	5993	50 %	25 %	25 %	0 %	414073326
130	NC_019435	AT	3	6	6120	6125	50 %	50 %	0 %	0 %	414073327
131	NC_019435	TTG	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073327
132	NC_019435	A	6	6	6236	6241	100 %	0 %	0 %	0 %	414073327
133	NC_019435	A	6	6	6281	6286	100 %	0 %	0 %	0 %	414073327
134	NC_019435	TGA	3	9	6304	6312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073327
135	NC_019435	AAG	2	6	6477	6482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073327
136	NC_019435	TTAT	2	8	6505	6512	25 %	75 %	0 %	0 %	414073327
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395	NC_019435	T	6	6	21041	21046	0 %	100 %	0 %	0 %	414073339
396	NC_019435	A	6	6	21048	21053	100 %	0 %	0 %	0 %	414073339
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